本发明公开了一种温度辅助认证的认证系统，在认证系统中增加一个可控的电压温度调节模块以实现二次认证，增设电压温度调节模块，双方根据挑战做出温度变化的应答，从而实现进一步的加解密映射，依靠双方内在的认证机制最终实现辅助认证的作用。同时提出一种温度辅助认证的认证方法，相比于环境温度难以控制，芯片温度可以通过电压、频率等因素进行有效调节。客户端和服务器端均采用定制芯片，根据双方认证要求进行数据传输以及温度调节，并进一步编解码，使得数据能够在特定的条件下传输并作为安全认证的一部分，从而实现辅助性的物理加密。借此，认证系统抵御中继攻击的能力增强，系统鲁棒性很强。