本发明涉及一种单胞藻培育车间光照强度自动控制系统及方法，该自动控制系统由处理器、光照强度探头、遮光板、驱动电机、照明灯和电流控制器等部件构成，通过实时比较饵料培育池当前受到的光照强度和目标光照强度的大小，在强光条件下调节遮光板角度、方向和照明灯的电流实现自动控光、在弱光条件下调节遮光板角度、方向和照明灯的电流实现自动补光灯，达到自动控制光照强度、促进饵料快速生长的目的。本发明不仅节省人力，而且能对光照强度实时调控，满足单胞藻生长的光照需求，从而提高单胞藻的培养效率。