本发明公布了一种基于LLVM的指令加花混淆方法及装置，该方法将待混淆的源程序转换为LLVM中间表示文件，并提取函数、原始基本块和指令信息；对每一个原始基本块内的所有指令进行依赖分析，按照指令间的依赖关系将原始基本块内的指令拆分为若干指令依赖集合，随机选择一个位置，将原始基本块切分为第一基本块和第二基本块；在第一基本块和第二基本块之间插入叠加跳转指令，进一步还可以插入虚假循环指令，将混淆后的中间表示文件转换为目标平台的可执行文件。本发明方法可在充分利用源程序中指令信息的同时，有效干扰逆向人员的分析，加大静态分析的难度；另外，本发明基于LLVM中间表示层，可应用于不同的前端编程语言和目标机器架构，具有通用性。