本发明公开了一种鉴定果桑品种‘粤椹143’的分子标记、鉴定引物组、试剂盒和应用。本发明利用荧光SSR技术，通过对桑树基因组序列设计开发出的300对SSR引物进行筛选，确认标记M20541和M22794的核心引物能够分别对果桑新品种‘粤椹143’扩增出三条特异性条带，可以分别从果桑品系中鉴别出果桑新品种‘粤椹143’，可用于果桑新品种‘粤椹143’的快速鉴定和检测。本发明通过直接检测‘粤椹143’的M20541标记和/或M22794标记对其进行鉴定，克服了外部形态特征对其鉴定的不确定性，操作简单，检测效率高，结果可靠直观，为果桑新品种‘粤椹143’的保护提供了科学的技术保障，本发明有利于该品种的推广利用和保护。