本发明涉及一种线圈类设备匝间绝缘缺陷诊断方法及系统，该方法包括：步骤1,利用高精度传感器采集线圈类设备的原边电压信号、副边电压信号、以及所有绕组的工频电流信号、高频局部放电信号；步骤2，对传感器信号进行调理，将电压传感器、电流传感器的信号变换成数据采集模块的输入电压范围；步骤3，通过不同通道同时采集调理后的各路传感器信号；步骤4，获取调理后的信号，计算激磁电流的矢量和，以激磁电流的相位差变化为差异系数并作为判据，诊断线圈类设备的匝间绝缘故障。本发明能够准确、高效、便捷的诊断出绕组的匝间绝缘缺陷，并且具有短路匝数越少，诊断辨别越灵敏的特性，可以在匝间故障早期及时发现诊断并采取措施。