本实用新型提供了一种植物叶片原态快速冷冻取样装置及取样系统，取样装置包括至少一个装置主体、控制系统和装置外围气路，装置主体相互串联在装置外围气路内，装置外围气路与控制系统连接；每一装置主体包括装置支架，以及安装在装置支架上的半开放叶室组件、冷冻锤、冷冻盒和气动驱动结构，冷冻锤位于半开放叶室组件的正上方，冷冻盒安装在半开放叶室组件的下方，气动驱动结构与冷冻锤连接，驱动冷冻锤向半开放叶室组件内取样获得试样，试样向下落入冷冻盒进行快速冷冻。本实用新型大幅减少了取样耗时、提高了取样准确度和冷冻可靠性，并且装置结构设计紧凑，可扩展性强，可以多机根据实验需要进行并联、串联，从而实现高通量标记取样。