本实用新型提供了一种光波导系统和近眼显示器。光波导系统包括：光波导片，光波导片为多个，多个光波导片至少包括两个叠置的光波导片；耦入光栅，耦入光栅设置在光波导片上，耦入光栅用于将外部光机发射的光耦入到光波导片内；转折光栅，转折光栅位于耦入光栅的一侧，转折光栅用于接收耦入光栅的光；功能结构区，叠置的多个光波导片上的耦入光栅对应设置，功能结构区设置在相叠置的多个光波导片中位于远离外部光机的一个或多个光波导片上，且功能结构区位于其所在的光波导片上对应的耦入光栅与转折光栅之间。本实用新型解决了现有技术中的光波导系统存在光线串扰难以改善的问题。