本实用新型提供了一种水泵轴密封结构，包括泵体，所述泵体内设有转轴，所述泵体的一侧设有泵端盖，所述泵端盖的中部设有穿轴孔，所述穿轴孔处设有套管，所述套管位于泵体内部，所述转轴从套管中穿过，所述转轴上套设有轴套，所述轴套位于套管内，所述轴套的中部套设有盘根，所述轴套的内端套设有压兰，所述压兰与泵端盖相连接，所述套管的外端设有挡环，所述转轴从挡环中穿过。本实用新型采用盘根代替现有的陶瓷密封片，有效防止水泵因输送介质温差变化过大，机械密封瓷片易碎裂，造成轴封漏水问题，从而减少设备故障，延长系统使用寿命，确保设备的运行效率；缩短了检修时间，提高了工作效率，降低了维修成本；结构简单，成本低廉。