本实用新型公开了一种用于医用加速器机房的通风系统，包括设备间和治疗间，设备间和治疗间之间通过隔断墙分隔开，设备间和治疗间相邻设置，所述隔断墙上设有若干连通口，连通口处设有封闭机构，隔断墙内嵌有加速器，加速器的机头与机臂端位于所述治疗间内，加速器的机架端位于所述设备间内，所述设备间和所述治疗间的地面处设有通风机构，设备间和治疗间内均匀布置有若干除湿机和若干空调，封闭机构与所述隔断墙上的连通口之间的缝隙处设有风向指示装置。使用本通风系统，操作简单，能使加速器在运行时基本不受治疗间的温湿度影响，稳定性大大提升。有利于操作人员根据患者情况要求调节治疗室的温度高低，改善治疗舒适度，有利于实现节能减排。