本实用新型公开了一种内窥镜及其光源系统，包括汇聚装置、驱动控制器、若干光源和若干透镜组，各所述透镜组与各所述光源分别对应设置以将对应所述光源的光线准直，所述汇聚装置设置于所述透镜组后方、用于将准直的光线汇聚于内窥镜镜体的导光部的通光孔上，所述驱动控制器与各所述光源分别连接用于控制各所述光源以不同的组合方式点亮。应用本实用新型提供的内窥镜及其光源系统，对于不同孔径的通光孔，能够通过驱动不同组合的光源，实现点亮光源的数量或位置的调节，使光源与内窥镜镜体的连接耦合效率提高，接通小通光孔径内窥镜镜体时导光部也能处于理想的温度，进而防止导光部过热造成对人体的损伤。