本实用新型公开了一种轨道传输系统，涉及医疗器械技术领域。该轨道传输系统，包括转运载体和运输轨道，所述转运载体用于运输装载样本的容器，所述转运载体设置在运输轨道的表面，所述运输轨道用于运输转运载体，所述运输轨道的表面设置有电机组件，所述电机组件用于驱动运输轨道，所述运输轨道的两端均设置有U型轨道，所述运输轨道的表面设置有条码阅读组件，所述条码阅读组件用于扫描转运载体，所述运输轨道的表面还设置有制动组件，所述制动组件用于制动转运载体。通过设置电机组件，制动组件以及变轨组件，达到了轨道安装简单的效果，解决了现有技术中，虽然能够实现轨道输送样本完成自动检测，但是轨道的对接技术及轨道安装相对比较复杂。