本实用新型涉及消毒技术领域，且公开了一种呼吸内科用临床消毒过滤装置，包括消毒箱，消毒箱呈侧面中心镂空的矩形体，消毒箱的左右两侧顶面均开设有两个孔且孔内套入有转轴，转轴的底面固定连接有输送辊，输送辊采用海绵材质，消毒箱顶面在对应四个转轴的位置均固定连接有套筒，转轴位于套筒内，消毒箱顶面中心开设有孔且固定连接有液箱，通过输送辊的设置，在需要消毒的器械输入到消毒箱内时自动排出消毒液对需要消毒的器械进行清洗，且在输送出消毒箱后自动擦干，具备节约方便使用和节约消毒液的好处，且相较于现有的消毒设备，不需要使用者操控按键，具备结构简单、使用方便和对使用环境要求低的好处。