本实用新型涉及棉球处理设备领域，具体为一种妇科用医用棉球处理设备，包括处理箱和防腐壳，所述处理箱的顶端设置有进料斗，且进料斗的两侧均安装有套板，所述套板的底端安装有装配管，所述进料斗的内部设置有限位层，所述进料斗的一侧设置有降噪壳，所述降噪壳的内部设置有驱动电机，所述驱动电机的底端设置有轴承，且轴承的底端安装有搅拌杆，所述搅拌杆的两侧均安装有搅拌叶。该妇科用医用棉球处理设备，通过限位层设置，防止棉球进入处理箱内时跳落到地面，同时设置搅拌叶对棉球进行搅拌，搅拌的同时，启动水泵，通过喷水头对搅拌时的棉球进行消毒，便于对棉球均匀消毒处理，实用性强，适合广泛。