本实用新型涉及鱼菜共生技术领域，尤其为一种集装箱式鱼菜共生系统，包括集装箱本体，所述集装箱本体内部下端设有鱼存储箱，所述鱼存储箱上端两侧转动设有支撑杆，所述支撑杆表面设有培养网箱，通过运输时将鱼放入鱼存储箱，蔬菜放入培养网箱，挂在支撑杆表面，培养网箱下端浸入鱼存储箱内部保持蔬菜的水分更新鲜，同时可降低运输时水晃动幅度，避免鱼在运输时产生大力碰撞导致死亡，制氧机通过充氧口向鱼存储箱内部充氧气，防止鱼脱氧，卸货时，打开开关门，启动第二驱动电机带动收线辊旋转，拉动钢丝绳，从而带动支撑杆倾斜旋转，当拿下一个培养网箱，其他的培养网箱会在支撑杆表面向开关门出滑动，方便拿取。