本实用新型公开了一种医用水凝胶基质烘干装置，包括烘干箱，所述烘干箱内安装有多个隔板，所述隔板上表面两侧安装有导向滑道，所述隔板上方设有盛放箱，所述盛放箱下表面两侧安装有导向块，所述导向块下端放置在导向滑道内，所述隔板一侧开有方形缺口，所述方形缺口内安装有转动辊，所述转动辊外侧安装有第一单向齿轮，所述第一单向齿轮一侧安装有第二单向齿轮，所述第一单向齿轮上方设有第一移动齿条，所述第二单向齿轮下方设有第二移动齿条。本实用新型的有益效果是，此装置可将上方的盛放箱放入烘干箱内时，自动将下方的盛放箱打开，便于放入水凝胶基质，并且还可使得晃动箱晃动，便于热气与水凝胶基质充分换热，提高了工作效率。