本申请涉及一种冷藏车制冷机组的供电控制系统及冷藏车，制冷机组包括直流供电电路、交流供电电路和电源切换控制终端，电源切换控制终端包括控制电路、交流电源输入检测端口和直流继电器控制端口，交流供电电路包括交流反馈电路，交流反馈电路用于将交流供电电路中的交流信号转换成弱电信号，交流电源输入检测端口与交流反馈电路连接，用于检测弱电信号是否存在，直流继电器控制端口与直流供电电路连接，控制电路分别与交流电源输入检测端口和直流继电器控制端口连接，根据弱电信号是否存在通过直流继电器控制端口控制直流供电电路导通或断开，实现新能源冷藏车制冷机组供电电源自动切换，避免出现供电异常问题，保证制冷机组正常运行。