本实用新型公开了一种全自动镜检进样识别机构，包括机体和顶罩，所述机体的顶端活动连接有顶罩。该全自动镜检进样识别机构通过设置有检测区域，将制好的载玻片放入检测区域，检测区域可以方便的对载玻片进行定位，后台程序通过检测镜进行调焦，调焦过程中自动的通过Z轴调整系统、X轴调整系统和Y轴调整系统带动载物台在活动槽的内部移动，从而带动载物台顶端的检测区域进行合适位置的调整，直到将检测区域调整至最理想状态后完成调焦，解决的是需要手动将制好的载玻片样本放入显微镜样仓底座，再通过肉眼来观察是否卡入了凹槽，需要手动对物镜进行调节，操作者需要长期忍受样本带来的气味，且工作效率低污染概率较高的问题。