本申请公开了一种蛋白质分离器水位调节装置，包括固定座以及设置在固定座一侧的调节机构、分离器、收集盒、气泵以及漏斗管，所述固定座顶部中轴处固定连接分离器，所述分离器顶部螺纹连接固定螺栓，所述固定螺栓一侧固定连接收集盒，所述分离器顶部中轴处开设有第一通孔。为了实现便于调节的功能，当需要对分离器的水位进行调节时，转动转动盘，转动盘带动与其固接的螺纹杆转动，螺纹杆带动与其螺纹连接的滑杆在固定管内开设的第一滑槽内向下滑动，同时滑杆带动把底部固接的活塞块下移，同时滑杆带动一侧固接的限位块在第二滑槽内下移，在活塞块下滑时，对分离器内的水位进行调节，实现了便于调节的功能。