本实用新型公开了一种院感科用消毒灭菌装置，包括消毒箱，其特征是：所述消毒箱的一侧上部分别活动连接对称的皮带轮的中心轴，两个所述皮带轮分别通过皮带相连接，对应的一个所述皮带轮的中心轴固定连接电机的输出轴，所述电机固定连接在矩形板的上侧，所述矩形板的一端固定连接在所述消毒箱的一侧上部，两个所述皮带轮的中心轴的端部分别固定连接对应的L形杆的一端，两个所述L形杆的轴杆分别设置在对应的直槽板内，本实用新型涉及消毒灭菌设备领域，具体地讲，涉及一种院感科用消毒灭菌装置。本装置可以实现两个过滤箱分别带动分类盛放的医疗器具等往复摆动，使医疗器具进行全面的消毒杀菌。