本实用新型涉及一种干燥箱与冷凝器的密封结构，包括干燥箱腔体和冷凝器腔体，所述干燥箱腔体和冷凝器腔体之间设置分隔板，将所述干燥箱腔体和冷凝器腔体隔开，形成两个独立的腔体；所述分隔板上的连通孔上面通过板层承托架和密封圈进行密封。通过干燥箱内部的板层承托架与干燥箱和冷凝器之间连接结构的配合形式达到密封的效果，优化了目前市面的冻干机耗材严重，占地空间大，控制点较多的缺陷。此结构形式简单，设计合理，比目前市面上常规冻干机主体部分节约空间10％～15％的空间，省去了常规冻干机上干燥箱和冷凝器之间控制阀门，节省了干燥箱和冷凝器之间的连接管材料，制造成本低。