本实用新型公开一种基于高通量反渗透膜的预脱盐系统，包括换热系统、过滤除杂系统和反渗透膜系统；所述换热系统包括第一换热器和第二换热器，过滤除杂系统包括沉淀池和超滤膜过滤装置，反渗透膜系统包括一级反渗透单元和二级反渗透单元；第一换热器的管程进口与原水池相连通，管程出口与沉淀池相连通，沉淀池的出口连通超滤膜过滤装置的进口，超滤膜过滤装置的出口连接调节池，在沉淀池和调节池均连接有药剂添加管道；调节池的出口通过第二换热器依次连接一级反渗透单元和二级反渗透单元，在一级反渗透单元和二级反渗透单元中均设置有高通量反渗透膜。本实用新型使得系统整体脱盐率达到99%以上，使用寿命超过五年，效果显著。