本实用新型公开一种风道菌监测传感器结构，包括控制系统、静压仓、设置在静压仓外部的步进电机和菌检测仪，静压仓的一端设有开口与风道联通，静压仓内设有一根转动连杆，转动连杆的一端到风道中，转动连杆的两端设有抓菌部件；步进电机的转轴伸入静压仓中与转动连杆的中心连接，抓菌部件能在指定位置静止；静压仓内设有杀菌灯，菌检测仪的探头伸入静压仓内靠近抓菌部件，所述步进电机、杀菌灯、菌检测仪由控制系统自动操控，菌检测仪与控制系统数据传输。本实用新型及时监测空气中细菌、病毒的含量和种类，有利于控制细菌、病毒的传染，维护公共健康。