本实用新型公开了一种富营养化水体净化系统，包括藻类吸附池、基质吸附池和沉淀池，藻类吸附池和基质吸附池的一侧分别连接有藻类吸附池出水口和基质吸附池出水口，且藻类吸附池出水口和基质吸附池出水口的一端分别与基质吸附池和沉淀池相互接通，藻类吸附池的内部设置有多组隔断墙，且多组隔断墙采用间隔排布的方式安装，多组隔断墙的表面均悬挂附着有丝藻藻甸，基质吸附池的池底表面设有吸附基质，沉淀池的池底设置有基质沙，基质沙上设置有沉水植物和生物盒。该种富营养化水体净化系统，结构简单合理，设计新颖，能有效降低水体的富营养化，净化效果较好，同时还有环保节能无污染的特点，实用性较高。