本实用新型公开了一种模块化生态浮岛系统，包括智能控制中心，智能控制中心包括数据管理平台、实时在线监测系统和生物复合酶制剂投加设备，实时在线监测系统和生物复合酶制剂投加设备均与数据数据管理平台相连接，智能控制中心还连接有多个模块化生态浮岛，所述模块化生态浮岛包括模块化的浮岛框架，在浮岛框架内侧底部设有底层托架，底层托架上铺设有培养基，在培养基上种植有植被层，所述模块化生态浮岛还具有检测探头组与实时在线监测系统相连接；本系统通过多个模块化生态浮岛，在水体中搭建类似人工湿地的结构，栽种沉水植物，对水体污染物去除并实现生态修复作用，通过生物复合酶输出模块与生物复合酶制剂投加设备，提高水体优化的效率。