本实用新型涉及一种活毒废水灭活消毒装置，包括接收容器、灭活容器、第一循环泵、第二循环泵、第一气液混合装置及负压挥发装置，其中，接收容器用于接收储仓活毒废水，接收容器的出口通过第一循环泵分别与灭活容器的入口以及第一气液混合装置的液体入口连通，第一循环泵与灭活容器入口之间设置有第一控制阀，第一循环泵与第一气液混合装置的液体入口之间设置有第二控制阀，灭活容器的出口通过第二循环泵与负压挥发装置的入口连通，负压挥发装置的气体出口通过单向装置与第一气液混合装置的气体入口连通；上述灭活消毒装置利用废热实现对活毒废水的预热，减少在灭活容器内的加温时间以及能耗，提高灭活消毒效率，有助于增大处理量，并节能减排。