本实用新型公开了一种动态扫码试剂孵育装置，包括试剂盘组件、孵育锅和扫码模块，所述试剂盘组件设置在孵育锅内，所述试剂盘组件包括连接平台，以及围绕连接平台周向设置的若干个相互固定连接的隔板件，所述隔板件之间形成放置试剂盒的第一试剂槽和第二试剂槽，所述第一试剂槽和第二试剂槽相对连接平台前后交错分布，所述第一试剂槽和第二试剂槽设置有互不干扰的扫码通道，所述孵育锅侧壁上设置有加热窗组件，所述扫码模块用于透过加热窗，扫描第一试剂槽和第二试剂槽内试剂盒的识别码。本实用新型具有双重试剂槽结构，且每个试剂槽对应的扫描通道相互独立可以实现同时对第一试剂槽、第二试剂槽或第三试剂槽内放置的试剂盒进行动态识别码扫描。