本实用新型公开了一种黄芩苷精馏提纯装置，包括：提纯箱，所述提纯箱的内侧分别设置有用于提纯的精馏机构和搅碎机构；所述精馏机构包括插接在提纯箱内腔下部的隔板、嵌套安装在隔板内的多个过滤网和连接在提纯箱内侧壁下部的导热板，所述提纯箱的一侧外壁安装有电加热器，且电加热器和导热板之间通过导热线连接，所述提纯箱的内腔上部插接有安装板，所述提纯箱的一侧外壁上部安装有收集箱，且收集箱和安装板之间连接有冷凝管，所述搅碎机构包括安装在提纯箱底部的电机和与电机输出端同轴连接的转杆。该黄芩苷精馏提纯装置，采用精馏和粉碎结合的方式提纯使得纯度更高，且方便对废料进行取出。