本申请公开了一种超净工作台灭菌装置，包括支撑板，所述支撑板下方固定安装万向轮，所述支撑板上方固定安装第一保护壳，所述第一保护壳内部设置净风系统，所述净风装置包括进风口、静压风箱、预过滤板、离心风机以及高效过滤器，所述第一保护壳下方设置操作台，所述操作台后方设置第二保护壳，所述第二保护壳内部设置熏蒸系统，所述熏蒸系统包括水箱、进水管、水泵、流通管、加热器、蒸汽管道、压力喷头以及调节阀，所述第一保护壳表设置操作面板。经过高效净风和熏蒸消毒，通过熏蒸系统产生高速消毒气体对整个装置进行消毒，净风系统用于给超净工作台提高无菌环境。