本实用新型涉及药液过滤技术领域，具体为一种药液杂质高效过滤系统，包括两个对称放置的支撑架，所述支撑架之间焊接有过滤箱，所述过滤箱上端盖设有箱盖，所述过滤箱包括焊接于所述支撑架之间的箱体、焊接于所述箱体下表面中间位置的电机、与所述电机输出轴同轴连接的转轴、焊接于所述电机周围箱体内部上的分隔板、转动连接于所述分隔板上表面的支撑板、焊接于所述支撑板上表面外围的圆形滤网、固定安装于所述分隔板外侧表面上的平面滤网，药液会接触到圆形滤网侧表面，不同时间进入的药液还会进入不同的位置，经过圆形滤网一次过滤后还会通过平面滤网二次过滤，不仅提高了滤网的利用效率，还能够多次过滤进一步确保药液内有效成分的含量。