一种扦插育苗专用的复合结构基质，由育苗钵体、基础基质和无机基质所组成，基础基质盛装在所述育苗钵体中，无机基质契合镶嵌或者致密填充于在基础基质中，组合构成扦插育苗专用的复合结构基质，利用无机基质中建立的水气配合协调体系，以及基础基质营养成分在无机基质中形成的扩散梯度，保证育苗插条快速发育生根，生成的根系扎入基础基质的同时逐步适应基础基质环境，在幼根根系形成的同时即从基础基质中获取营养补充，无需再经缓苗期而直接进入壮苗期，实现苗木克隆繁育全过程均在一个育苗钵体内一站式完成，应用于扦插育苗工艺中，能够简化过程、降低成本，提高育苗的生产效率和苗木的繁育质量，有利于促进苗木克隆繁育技术的拓展和创新。