本实用新型公开了一种恒温细菌培养皿，包括第一壳体，所述第一壳体内部固定设有分隔板，所述分隔板将第一壳体内部分隔为第一腔体和第二腔体，所述分隔板底端固定设有双轴电机，所述双轴电机输出轴顶端贯穿分隔板并延伸至第一腔体内部，所述双轴电机输出轴两端分别固定设有第一搅拌桨，所述第一搅拌桨设在第一腔体内部，所述第一腔体内部设有三个搅动机构。通过双轴电机带动第一搅拌桨和第一锥齿轮转动，第一锥齿轮转动时可通过驱动机构带动第一转杆和第二搅拌桨转动，第一搅拌桨和多个第二搅拌桨共同配合对第一腔体内部的水进行搅动，使得第一腔体内部所有的水温度全部相同，尽可能的降低了对细菌培养所得实验数据的误差。