本实用新型公开了一种瓶子上行柔性压盖机构，其包括空心轴，所述空心轴的上端设有吸盖盘，所述吸盖盘的底部开有多个吸孔，所述吸盖盘与空心轴之间设有真空分配阀，所述吸孔通过真空分配阀与空心轴连通，所述吸盖盘的下方设有拨轮，所述拨轮的下方设有多个托瓶套，所述托瓶套连接有升降组件，所述吸盖盘、拨轮和托瓶套均与空心轴转动连接。与现有技术相比，本实用新型通过将真空分配阀直接连接吸盖盘，以及将传统的瓶盖下移方式改为瓶子上升方式，精简了压盖盘的结构，使瓶子与瓶子的节距更小，在压盖的过程中，不需要拉开到很大的节距，有效解决了在拉开节距过程中药液外溢的现象。