本实用新型揭示了一种船用电子设备防护装置，包括箱体，箱体上设有门，箱体平行相对的两块侧板上靠近顶部分别设有进气口、出气口，出气口处设有散热风扇，箱体内设有两块均流板，均流板分别靠近进气口、出气口立起设置，两块均流板之间设有隔板，均流板上与每层储物空间均对应设有通孔，与每层储物空间对应的通孔的总面积由上至下递增。本实用新型通过设置均流板可以使箱体内部各层储物空间的换热效果均匀，保障各层储物空间内的电子设备均匀散热，通过设置进气防护机构和防水罩，可以降低箱体内部进水的风险，通过设置由透波材料制成的顶罩，可以降低箱体对无线信号的屏蔽，箱体内部的无线通讯设备可以更好的和外界通讯。