本实用新型提供了一种含氟废水的处理系统，阳离子再生废液供给单元提供阳离子树脂再生废液。反应池与所述阳离子再生废液供应单元的出口相连，所述阳离子树脂再生废液与含氟废水在所述反应池内以第一比例值混合，形成第一混合液。PH调节模块设置于所述反应池，用于调节所述第一混合液的PH。加药装置用于向所述第一混合液加入絮凝剂溶液，以产生絮状物。絮状物分离单元设置于所述反应池的出口，用于将所述絮状物从所述第一混合液中分离，得到清液。在本实用新型的含氟废水的处理系统中，实现了利用阳离子树脂再生废液来处理含氟废水，大幅减少除氟药剂的使用量，降低含氟废水处理成本。且所述含氟废水的处理系统还能够更高效的处理含氟废水。