本实用新型涉及一种全自动高通量多功能染色机，包括内有容置空腔的底座，底座上表面间隔设置有用于存放TIP头的TIP头座、用于存放试管的试管座、染色基座、存放试剂的试剂座、清洗槽、在底座上方能三轴移动的机械臂，底座的侧壁上设置有操控机构，底座上设置有控制线路板，操控机构和机械臂均和控制线路板电性连接，机械臂上设置有取样机构。该实用新型可以在细胞制片染色时提取转移和释放含细胞的样本溶液，后续流程和免疫组化染色兼容使用其他组件，实现了多功能染色，同时还可存放多种类，多规格容量试剂，根据现有的实际需求，实现了高通量。