本实用新型公开了一种具有保护结构的高效液相色谱仪，包括：机壳，顶部一侧固定连接有固定块，所述固定块内部开设有与滑轴表面相匹配的槽，且固定块与滑轴之间为滑动连接结构，所述滑轴的一侧固定连接有防护盖，所述防护盖远离滑轴的一端固定连接有连接块，压块，底部连接有连接块。该具有保护结构的高效液相色谱仪，当装置使用时，推动压块，压块挤压弹簧，使得弹簧发生形变，直到压块的一端与连接块相互分离，之后推动防护盖，使得防护盖两侧的滑轴在固定块上滑动，并通过滑轴转动防护盖，从而将防护盖打开，当不使用时将防护盖盖在机壳的顶部，进而使得防护盖能够对不使用时的装置使进行保护，避免装置的顶部进入灰尘等杂物。