本申请提供了一种疫情防控分流设备及系统，所述疫情防控分流设备包括外壳、电路控制板、证件阅读装置、二维码扫描装置、红外测温装置、人脸摄像头以及触控屏；所述电路控制板设置于所述外壳内；所述电路控制板能够根据人脸图像及证件信息验证旅客身份，并根据体温、行程码和/或健康码在所述触控屏上显示分流信息；本申请的疫情防控分流设备通过所述电路控制板能够根据人脸图像及证件信息验证旅客身份，确保人证合一，建立旅客的防疫健康信息和行程资料的电子申报卡，并根据旅客的行程码和/或健康码、体温信息分析防疫风险等级，能够提前分离行程途径高风险地区以及体温异常的旅客，既可以降低疫情感染风险，又可以简化流程、提高通关查验效率。