本实用新型属于环境生物工程领域，具体涉及用于环境修复可移动式微生物发酵装置，包括外部设有保温层的发酵箱，发酵箱内设有隔板，隔板将发酵箱分隔为两个发酵腔室，发酵箱顶部开设排气口，两个发酵腔室顶部相互连通且均与排气口连通，每个发酵腔室均设有盘管，盘管的两端口与发酵箱外部连通。本实用新型发酵箱设有独特的两腔室设计，可根据工艺的实际情况对菌剂的发酵量进行有效控制，当每次菌剂使用量不大，且现场不具备保存条件的情况下，避免了不必要的浪费。此外，本实用新型为整体可移动式设计，便于运输和现场使用，极大降低了微生物制剂的生产及运输成本，并且可以随时根据项目的需求提供高活性的微生物制剂，保证了项目的成功率。