本实用新型公开了一种具有防水结构的台式高速冷冻离心机，涉及高速冷冻离心机技术领域。该具有防水结构的台式高速冷冻离心机，包括离心箱、防水机构和散热机构，防水机构位于离心箱的内部，散热机构位于防水机构的下方，防水机构包括密封塞、连接杆、密封盖和手柄，散热机构包括电机、转动轴、转动杆、齿轮和散热扇。本实用能够对离心箱进行散热，对离心箱进行运转时产生的热能进行处理，防止电机长时间处于高温的状态，容易对电机内部的元件造成损伤，还能够对离心室内的试管起到密封的作用，防止在进行离心运动时，快速的运转使得试管内的液体甩出来，对离心箱内的部件造成破坏。