本实用新型公开了一种高能电子PET瓶杀菌设备，涉及杀菌设备技术领域，针对PET瓶在生产过程中，一般需要人工使用消毒液的方式进行清洗杀菌，导致浪费人力资源且工作效率低的问题，现提出如下方案，其包括箱体，所述箱体侧壁贯穿设有第一承重层，所述箱体外侧壁山固定设有第二承重层，所述第一承重层上设有传输机构，所述箱体顶部贯穿设有两个结构相同的隔板，两个所述隔板顶端均固定设有连接板，所述箱体内设有高温蒸汽杀菌机构和烘干机构。本实用新型结构新颖，实现了替代人工清洗杀菌方式，不仅尽量避免人力资源浪费的现象发生，还提高了工作效率，适宜推广。