本实用新型公开了一种船用耐腐蚀法兰连接结构，其技术方案要点是：包括主法兰，所述主法兰的一侧设置有副法兰，所述副法兰的左侧开设有若干个第一连接孔，所述副法兰的右侧开设有若干个第二连接孔，所述第二连接孔的内部活动套接有螺栓；通过设置螺纹槽，在对主法兰和副法兰连接之前，可通过将连接环与螺纹槽连接在一起，此时将副法兰的左端外圆壁面套接在连接槽的内部，橡胶环塞入密封槽的内部，再通过螺栓分别穿过第二连接孔、第一连接孔和第三连接孔与第一螺母螺纹连接在一起，实现紧密连接主法兰与副法兰的效果，实现覆盖和密封主法兰和副法兰之间的间隙，避免管道内部的流体从连接缝渗出腐蚀法兰。