本实用新型属于肝素钠提取设备技术领域，尤其为一种肠粘膜肝素钠提取装置，包括反应釜，所述反应釜的顶部固定连通有两个进料管，所述反应釜的顶部固定设置有安装筒，所述安装筒的顶部固定设置有气缸，所述气缸的输出轴上固定设置有移动安装座，所述移动安装座的底部固定设置有搅拌电机。本实用新型通过横向搅拌杆和竖向搅拌杆的边旋转边升降，增大了搅拌的区域，使得搅拌效果更好，加快了肝素钠析出分离的速率，通过清理刷的边旋转边升降，可把反应釜内壁上粘附的提取液给刷掉，使得提取液可完全出料，通过外接的过滤筒和过滤网的配合，便于过滤出提取液中的肠粘膜残留物，保证了提取液的纯度。