本实用新型涉及一种鹿茸菇菌种无菌输送装置,包括连通摇床室与镜检室的无菌通道，无菌通道的内部嵌设有消毒柜，在消毒柜的内部安装有消毒装置，在消毒柜的两端均铰接有无菌输送门，在消毒柜侧壁内嵌设有双门互锁装置，双门互锁装置包括两个顶杆，两个顶杆相对的一端均设有顶板，两个顶板通过定长弹簧弹性连接，两个顶杆的另一端均伸出消毒柜，两个顶杆靠近消毒柜两端开口处设有锁钩，所述锁钩伸出消毒柜，在无菌输送门上设有锁扣。本实用新型的结构合理，实用性强，密封性强，通过在消毒柜侧壁内嵌设双门互锁装置，使两个无菌输送门同时只能开启一扇，阻止了镜检室的空气流动到摇床室内，避免细菌传播，降低了鹿茸菇菌种块被感染的风险。