本实用新型提供一种生物污水处理系统，属于污水处理技术领域，该生物污水处理系统包括底板，底板的上表面固定连接有箱体，箱体的顶端固定安装有箱盖，箱盖上贯穿有转动杆，转动杆的外表面固定连接有搅拌叶，转动杆的顶端设置有第一驱动装置，箱体靠近搅拌叶的内壁滑动连接有刮刀，刮刀上设置有用于带动刮刀沿着箱体内壁进行升降运动的第二驱动装置。该生物污水处理系统，进行过滤时，经过第一驱动装置带动转动杆转动，从而带动搅拌叶持续稳定的搅拌处理后的污水，保障污水能够快速稳定的过滤，同时经过第二驱动装置带动刮刀上下移动，能够快速的清洗设备内壁，避免污染物堆积，保障污水处理效果，同时有利于降低设备的损耗。