本实用新型公开了一种高效磁种回收装置，其包括污泥存储罐、高剪均质机、分选箱和分选机构；所述的高剪均质机的进料口与污泥存储罐连通，高剪均质机的出料口与分选箱连通；所述的分选箱处设置有导流筒；所述的分选机构包括电机、永磁圆筒和刮板，永磁圆筒和刮板均设置于分选箱内，永磁圆筒的轴心与电机的输出轴连接，刮板固定在导流筒的上方，且刮板与永磁圆筒的表面接触。本实用新型涉及的高效磁种回收装置利用电机带动永磁圆筒旋转，带磁种污泥经过高剪均质机剪碎后输入分选箱，借助旋转的永磁圆筒吸附磁种，进而将磁种和污泥分离，再用刮刀将磁种从永磁圆筒挂下，收集磁种，实现磁种高效回收。