本实用新型公开了一种阶梯式水产养殖尾水处理系统，包括呈阶梯状设置的尾水沉淀池、生物处理池和水质指标检验池，在生物处理池与尾水沉淀池的连接处、生物处理池与水质指标检验池的连接处分别设置有生物过滤坝；生物过滤坝上设有过滤室，尾水沉淀池、水质指标检验池上分别设有尾水进水管和出水管，尾水沉淀池的底部通过排污管与外部沼气池连接，排污管上安装有开关阀和平衡阀；在生物处理池内间隔安装有多根生物过滤毛刷。本实用新型的阶梯式的设计，存在的落差方便尾水流动；沉淀物也可通过沼气池重新利用；而生物处理池中的生物过滤毛刷可以有效去除尾水里的有害物质；而生物过滤坝作为处理池之间的过渡，能提高尾水的净化效率及净化效果。