本实用新型公开了一种肥料自动包衣系统，包括皮带秤、控制柜、混料箱、粉仓以及油仓，混料箱分别与皮带秤的卸料端、粉仓以及油仓连通，皮带秤设置有称重传感器，控制柜设置有控制器，粉仓具有出粉口，油仓具有出油口，出粉口设置有第一计量泵，出油口设置有第二计量泵，称重传感器用于测量皮带秤上肥料的重量数据并发送至控制器，控制器分别控制第一计量泵的出粉量以及第二计量泵的出油量；混料箱开设有多个进粉口，粉仓还具有进粉通道，进粉通道内设置有振动筛网。实现从肥料的称重、运输，到包衣加工的自动控制，节省了劳动力，提高了加工效率。振动筛网使大块的粉料分散成粉末状，提高了粉料对肥料颗粒的包裹效果，进而提高包衣效果。