本实用新型公开了一种防疫消毒门隔断结构，该消毒门隔断结构旨在解决现在的消毒门隔断整体开合的结构功能单一，使用不灵活的技术问题。该消毒门隔断结构包括一号门体、设置于所述一号门体下方的二号门体、设置于所述一号门体和所述二号门体之间的平衡梁、竖向设置于所述一号门体和所述二号门体左侧的活动轴。该消毒门隔断结构采用一号门体、二号门体和平衡梁的三部分组装形成门体的结构，可以单独运用各组件，变化为全隔断或半隔断的形式，通过在二号门体内的通槽结构，大大降低门体的自重，方便消毒门的灵活使用，通槽和栏杆的内嵌式设计使消毒门的封闭性更好，避免病菌利用通槽在门体两侧的空间中交换流通，具有优良的防疫效果。