本实用新型属于肝素钠制备领域，尤其是一种小肠黏膜酶解法制备肝素钠装置，针对现有制备装置在过滤溶液时，滤袋需要经常取出清理，人工清理费时费力，降低了制备装置的加工连续性的问题，现提出如下方案，其包括制备罐一、搅拌组件、过滤控制盒、制备罐二、过滤板和清理机构，所述搅拌组件设置在制备罐一内，所述过滤控制盒固定安装在制备罐一的底部，所述制备罐二固定安装在过滤控制盒的底部，所述过滤控制盒的底部和顶部均为开口。本实用新型的制备装置在过滤溶液时，可以自动过滤板进行清理，可将堆积堵塞在过滤板上的杂质清理到两侧的筛分盒内，提高了制备装置的加工连续性。