本实用新型公开了一种双螺杆燃料电池空压机，包括底座，所述底座的上表面依次安装有空压机壳体和驱动电机，所述驱动电机的一侧安装有燃料电池，所述燃料电池与驱动电机之间电线连接，所述空压机壳体的一侧与驱动电机之间固定安装有连接管。本实用新型中，在对第一齿轮和第二齿轮维护更换时只需将顶部的螺栓和螺母取下，便能转动防护壳将防护壳打开，进而便能够进行维护，操作简单，大大方便维护人员，过滤网可以将进入空压机内部的空气进行过滤，从而避免灰尘颗粒进入空压机内部造成磨损，驱动电机转动通过传动机构带动除尘防堵机构运行，从而可以将粘附在过滤网上的灰尘除去，大大增加了空压机的使用寿命。